vanspor, 1974 yılında renkleri siyah-beyaz olan van gençlikspor ve sarı-lacivert renklerine sahip şengençlerspor amatör takımlarının birleşmesiyle sarı-siyah renklerle vanspor adıyla kuruldu.
1982-1983 sezonunda 1915'te ruslar tarafından işgal edilen ve ermeni çeteleri tarafından yakılıp yıkılan, katliama uğrayan van'ın bu acılı, yokluk, kara ve yaslı günleri yansıtan siyah, 2 nisan 1918 düşman işgalinden kurtuluşunun ve istiklâlinin şehit kanlarını yansıtan kırmızıyı alarak kırmızı-siyah renklerle terfi ligine katılan vanspor, aynı sezon içinde 2. lige yükselmiştir.
vanspor, 1993-1994 sezonunda en üst kademe olarak kabul edilen 1. lig'e çıktı. 1997 yılında rengini mavi-beyaz olarak değiştiren kulüp, 1997-1998 sezonunda sonuncu olarak 2. lige düştü. ertesi sezon yeniden 1. lige çıktı. 1999-2000 sezonunda 2. lige düştü. 2000-2001 sezonundan sonra 2. lig b kategorisi'ne (3. kademe) kabul edilen kulüp, 2001-2002 sezonunda 3. lige, ertesi sezon amatör lig'e düştü. bu kulüp amatör ligde isim değiştirerek il özel idaresi vanspor adını aldı. halen il özel idaresi vanspor adıyla amatörde oynamaktadır.