futbol federasyonu 1966 yılında cumhurbaşkanlığı kupasını başlatmıştır. cumhurbaşkanlığı kupası türkiye birinci ligi'nde birinci olan takımla, federasyon kupası birincisi arasında oynanmaktadır. türkiye profesyonel birinci lig şampiyonu aynı zamanda federasyon kupası'nı da kazandığı taktirde, cumhurbaşkanlığı kupası'nı birinci lig ikincisi ile oynamaktadır. kupa 1981 ve 1982 yıllarında "devlet başkanlığı" adı altında oynanmıştır. 1997-1998 sezonunda son kez düzenlenen kupanın bir benzeri 2005-2006 sezonunda tff süpr kupa adı altında ve finalleri türkiye dışında bir ülkede oynanarak tekrar düzenlenmeye başlanmıştır.
ilk cumhurbaşkanlığı kupasını o sezonun türkiye kupası şampiyonu olan galatasaray, lig şampiyonu beşiktaşı 2-0 yenerek müzesine götürmüştür.
ilginç bir not olarak o sezon türkiye kupasını kazanan galatasaray finalde de yine beşiktaş ile karşılaşmış ve 1-0 kazanarak türkiye kupasını kazanmıştır.
