1956-57 ve 1957-58 sezonlarında olmak üzere 2 kere düzenlenen federasyon kupasının ikisini de beşiktaş müzesine götürmüştür. bu sayede -lig organizasyonu olmadığından- 2 kere şampiyon kulüpler kupasına katılma hakkı kazanmış ama ilkinde federasyon beşiktaş'ı uefa'ya bildirmediğinden katılamamıştır.
yıllar sonra türkiye futbol federasyonu bu 2 federasyon kupasını kazandığı için beşiktaş'a -hala tartışılan bir kararla- 2 tane "lig" şampiyonluğu hediye etmiştir.