cem pekin'in hazırladığı ve turkish-soccer.com sitesinde yayınlanan bilgilere göre atatürk kupası; cumhurbaşkanlığı kupası ve başbakanlık kupası'nı kazanan takımların karşı karşıya geldikleri tek maçlık bir kupa olarak düşünülmüştür. bu bağlamda ilk atatürk kupası karşılaşması 1997-1998 sezonunda yapılan http://www.macanilari.com...etir.php?fid=199719989603 adresindeki maçtır. 1999'da yaşanan marmara depremi yüzünden atatürk kupası 2. yıl düzenlenmemiştir. 2000 yılında cumhurbaşkanlığı ve başbakanlık kupası sona erdiğinden, kupanın yeni statüsü cumhurbaşkanlığı kupası ile aynı oldu. yani lig şampiyonu ve türkiye kupası galibi karşılaşacak şekilde düzenlendi. 2001 ve 2002 sezonlarında da yoğun uefa kupalarının maç trafikleri nedeniyle yapılmadı ve 2002-2003 sezonunda tamamen kaldırıldı.
