3. tur maçları, 2. turdan yükselen 13 takım, 1987-88 türkiye 1. ligi'nde ilk 16 sırayı alan takımlar ve 1987-88 türkiye 2. ligi'nden yükselen 3 takımla birlikte toplam 32 takımla oynanmıştır.
kocaelispor: okan gedikali, murat beşel, olcay danacı, osman çakır, osman karakaya, ayhan eryılmaz, melih gürbüztürk, alaattin arslan (dk. 46 erhan altın), bülent baturman, mustafa aydın (dk. 46 murat vatansever), orhan görsen
teknik direktör: nihat atacan
altay: zafer öğer, miodrag jesic, serdar berkin, yüksel kepoğlu, mustafa eskisoy, mehmet öztürk, ramazan torunoğlu, ali güleryüz, alper timur, hikmet şıktaşlılar, müjdat atıcı
) 
