3. tur maçları, 2. turdan yükselen 13 takım, 1987-88 türkiye 1. ligi'nde ilk 16 sırayı alan takımlar ve 1987-88 türkiye 2. ligi'nden yükselen 3 takımla birlikte toplam 32 takımla oynanmıştır.
sakaryaspor: neşet muharremoğlu, blerim mula, selçuk yiğitlik, murat doğansoy, mehmet şen, erol kolcu, hüseyin hürsoy, şenol kaba, faton bingazi (dk. 37 rahim zafer), yücel çolak, halil ibrahim eren (dk. 46 mustafa gölpınar)
teknik direktör: tamer kaptan
trabzonspor: şevki ekşi, kemal serdar, lemi çelik, aykut canik, hamdi zıvalıoğlu, ismail gökçek, mitar lukic, iskender günen, soner boz, hasan şengün, murat şimşek (dk. 85 hamdi aslan)
teknik direktör: şenol güneş
gol: (1-0) dk. 52 hüseyin hürsoy (1-1) dk. 60 soner boz (2-1) dk. 80 yücel çolak
sarı kart: dk. 41 hüseyin hürsoy, dk. 75 mustafa gölpınar (sakaryaspor) dk. 56 soner boz (trabzonspor)