türkiye ligi henüz kurulmadığı için avrupa şampiyon kulüpler kupasına katılacak takımı belirlemek amacıyla futbol federasyonun, geçen sezon uygulamaya koyduğu "federasyon kupası" maçlarında beşiktaş bir kez daha birinci oldu ve türkiye'yi avrupa'da temsil etme hakkını elde etti.
beşiktaş, turnuvanın 1. turunda yunanistan şampiyonu olympiakos ile eşleşti. yunan takımı politik nedenlerle ve iki ülke arasındaki soğukluk nedeniyle maçlara çıkmak istemedi. bu nedenle uefa komitesi beşiktaş'ı iki maçta da hükmen galip ilan etti. beşiktaş, avrupa kupalarında maç yapmadan tur atlayan ilk türk takımı oldu. ikinci turda ispanya 'nın real madrid takımı ile eşleşti. 0-2 ve 1-1 lik skorlarla elendi.
1956-57 ve 1957-58 sezonlarında olmak üzere 2 kere düzenlenen federasyon kupasının ikisini de beşiktaş müzesine götürmüştür. bu sayede -lig organizasyonu olmadığından- 2 kere şampiyon kulüpler kupasına katılma hakkı kazanmış ama ilkinde federasyon beşiktaş'ı uefa'ya bildirmediğinden katılamamıştır.
yıllar sonra türkiye futbol federasyonu bu 2 federasyon kupasını kazandığı için beşiktaş'a -hala tartışılan bir kararla- 2 tane "lig" şampiyonluğu hediye etmiştir.
