istanbul futbol ajanlığının tertip ettiği istanbul kupası'nın beşinci sezonuna istanbul 1. ve 2. küme'den toplam 36 kulüp iştirak etmiştir. 2 eylül 1945 ile 17 şubat 1946 tarihleri arasında oynanmıştır. tek maçlı eleminasyon sistemine göre oynanan müsabakalarda; galip bir üst tura geçerken, mağlup takım elenmiştir. müsabakanın berabere bitmesi halinde ise bir maç daha oynanmıştır.
