3. tur maçları, 2. turdan yükselen 13 takım, 1987-88 türkiye 1. ligi'nde ilk 16 sırayı alan takımlar ve 1987-88 türkiye 2. ligi'nden yükselen 3 takımla birlikte toplam 32 takımla oynanmıştır.
kocaelispor: okan gedikali, murat beşel (dk. 88 bülent gürbey), erhan altın, olcay danacı, osman çakır, bülent baturman, ayhan eryılmaz, osman karakaya, melih gürbüztürk, orhan görsen, mustafa aydın (dk. 64 hüseyin durucan)
teknik direktör: nihat atacan
beşiktaş: rade zalad, kadir akbulut, recep çetin, ulvi güveneroğlu, gökhan keskin, şenol fidan, zeki önatlı (dk. 68 metin tekin), mehmet özdilek, turan uzun (dk. 68 les ferdinand), feyyaz uçar, ali gültiken