3. tur maçları, 2. turdan yükselen 13 takım, 1987-88 türkiye 1. ligi'nde ilk 16 sırayı alan takımlar ve 1987-88 türkiye 2. ligi'nden yükselen 3 takımla birlikte toplam 32 takımla oynanmıştır.
beşiktaş: rade zalad, kadir akbulut, şenol fidan, gökhan keskin, ulvi güveneroğlu, recep çetin (dk. 46 metin tekin), mehmet özdilek, zeki önatlı, halim okta, rıza çalımbay, feyyaz uçar
teknik direktör: gordon milne
kocaelispor: okan gedikali, olcay danacı, osman çakır, murat beşel, sefer yılmaz, erhan altın, melih gürbüztürk, ayhan eryılmaz, osman karakaya, orhan görsen (dk. 89 senai kara), mustafa aydın (dk. 75 hüseyin durucan)
teknik direktör: nihat atacan
gol: (1-0) dk. 67 gökhan keskin (2-0) dk. 71 metin tekin (2-1) dk. 76 melih gürbüztürk
kırmızı kart: dk. 21, 32 sefer yılmaz (kocaelispor)