başbakanlık kupası ilk kez 1944 yılında oynanmaya başlanmıştır. 5 yıl devam eden kupa, türkiye amatör futbol birincisi ile milli küme şampiyonu arasında oynanmıştır. 1950 yılında milli küme'nin son bulması ile başbakanlık kupası da 1966 yılına kadar yapılmamıştır. 1966 yılında futbol federasyonu uygulamayı yeniden başlatmıştır. başbakanlık kupası çeşitli statülerle oynatıldı. 1982, 1983 ve 1984'de kupaya ara verildikten sonra 1998'e kadar oynatılmaya devam edildi. 1997-1998 sezonu ardından kupa rafa kaldırıldı.
not: "amatör futbol birincisi" diyince insanın aklına günümüzdeki amatör küme geliyor ama aslında profesyonel lig öncesi olduğu için amatör diye geçiyor. o yıllarda türkiye futbol birinciliği ve milli küme birinciliği adı altında 2 farklı lig vardı.
